Universitetet i Tromsø har ennå ikke avlevert sine arkiver til depot. Etter hvert som eldre papirbaserte arkiver er ordnet er det laget arkivlister over de enkelte arkivperiodene. Disse listene blir ikke lagt ut i arkivplan.no men vil bli arkivert i sak-/arkivsystemet.

Følgende arkiver fra institusjoner som i sin tid ble inkorporert i Universitetet i Tromsø er avlevert til Statsarkivet i Tromsø:

• Tromsø Museum (1872 - 1975)
• Nordlysobservatoriet i Tromsø (tidligere Det geofysiske institutt i Tromsø) og Observatoriet på Hallde (1926 - )
• Norges fiskerihøgskole (1972 - 1992)

Materialet er ordnet av Statsarkivet i Tromsø og kataloger er arkivert hos UiT.

Eldre papirbasert arkiv fra Høgskolen i Tromsø, og fra høgskolens forløpere frem til 31.07.1994, er avlevert til Statsarkivet i Tromsø.